Após Brennan ser acusada de assassinato, seu pai a ajuda a se esconder do FBI. Enquanto isso, Booth e o time do Jeffersonian tentam provar que o vilão e gênio da computação manipulou as evidências para implicar a antropóloga. Mais tarde, uma dica anônima leva o time até os restos mortais do conselheiro de um colégio da região, caso que pode conter a chave para provar a inocência de Brennan.

Um advogado de divórcio poderoso com um monte de inimigos é assassinado; a separação de três meses de Booth e Brennan começa a cobrar seu preço.

Depois de uma explosão em uma garagem de hotel, a equipe do Jeffersonian tenta identificar as vítimas investigando vestígios encontrados na cena do crime.

Enquanto investiga a morte de um empregado de exposição de animais, a equipe é atraída para o mundo do tráfico de animais; Brennan acha que ela seria uma boa candidata presidencial; Sweets e Daisy fazem uma mudança.

A equipe investiga a morte de uma mulher cujo corpo foi encontrado no lixo; Booth convida Sweets para ficar com ele e Brennan até que ele encontre um novo lugar.

Enquanto examinam corpos considerados não identificáveis, estagiários descobrem a identidade de um homem que morreu nos ataques terroristas de 11 de setembro.

Um casulo contendo os restos mortais de um limpador de cena do crime aparece em uma praia; Angela e Hodgins descobrem um segredo sobre Cam.

Quando um artista de rua cai em seu próprio adesivo, ele também cai em restos humanos que ficam colados ao seu corpo; Booth investiga um clube de comédia por suspeitos.

Quando uma vidente tenta ajudar o espírito de um menino cuja morte a equipe está investigando, os membros da equipe começam a questionar seus próprios sentimentos sobre a vida e a morte.